而且盐酸左氧氟沙星水溶性强，易于溶解吸收，所以目前在临床上大多数都使用左氧氟沙星较多。
左氧氟沙星主要针对革兰氏阴性菌，比如大肠埃希菌，不动杆菌，克雷伯杆菌。对一些阳性菌如肺炎链球菌、葡萄球菌也是有抗菌活性的。临床上主要用于下呼吸道感染，泌尿道感染，皮肤软组织感染，盆腔感染。
莫西沙星是第四代喹诺酮类抗菌药物。1999批准用于临床，它的口服利用度90%以上，所以其口服剂型与注射剂性效果相当。
莫西沙星相比左氧氟沙星抗菌谱更广，除了阳性球菌、阴性杆菌，它对非典型病原体如支原体、军团菌以及厌氧菌作用效果要强于左氧氟沙星。临床主要用于支气管炎急性发作，医院获得性肺炎。
从临床效果来看，莫西沙星要优于左氧氟沙星。主要原因是莫西沙星抗菌谱广，而且由于左氧氟沙星上市时间已久，使用时间长，使用范围广，有些细菌已经对其出现了严重的耐药现象，如大肠杆菌耐药率超过了60%，莫西沙星上市晚，使用时间短，目前细菌对其耐药率还是比较低的。
另外左氧氟沙星和莫西沙星都被称之为呼吸喹诺酮类，这是因为该类药物在肺组织中浓度高，相比而言莫西沙星在肺泡组织中浓度高于左氧氟沙星。
也有一些关于莫西沙星与左氧氟沙星治疗下呼吸道感染的临床疗效对比等文献研究显示，莫西沙星对细菌清除率和总疗效要高于左氧氟沙星。
不良反应方面两者都可能引起胃肠道反应，以及神经系统症状，还可能导致肌腱炎。另外可能引起血糖异常，所以在使用的时候要注意，特别是老年人，糖尿病患者。
临床上是选择莫西沙星还是盐酸左氧氟沙星需要根据细菌感染严重程度、对药物是否耐受，是否耐药等情况综合考虑，由医生决策，患者不要自行选用。
