现代药理学研究发现，通窍鼻炎颗粒可减少急性炎症渗出，防止炎症组织增生，减少炎症细胞在鼻黏膜浸润，减轻组织水肿，减轻鼻黏膜充血，改善黏膜上皮细胞损伤，具有抗炎抗过敏作用。此外，体外抗菌试验表明，通窍鼻炎颗粒对金黄色葡萄球菌、链球菌、大肠埃希菌、铜绿假单胞菌、痢疾志贺氏菌有明显抑制作用，对于病毒、真菌、支原体都具有一定抑制作用，具有抑菌抗病毒作用。**，有研究表明，通窍鼻炎颗粒还可增强免疫功能，改善过敏性鼻炎的免疫紊乱状态。
儿童过敏性鼻炎又称儿童变应性鼻炎，中医称为“鼻鼽”，是机体暴露于过敏原后发生的由免疫球蛋白E介导的鼻黏膜非感染性炎性疾病，鼻痒、鼻塞、打喷嚏 、流清水样涕是其典型症状，根据症状发作时间可以分为间歇性过敏性鼻炎(每周症状发作<4天或<连续4周)、持续性过敏性鼻炎(每周症状发作≥4天且≥连续4周)，根据症状严重程度可分为轻度过敏性鼻炎(症状轻，对生活质量未产生明显影响)、中-重度过敏性鼻炎(症状较重或严重，对生活质量产生明显影响）。对于儿童轻度间歇性 过敏性鼻炎，单独使用通窍鼻炎颗粒可改善鼻部过敏症状，也可与氯雷他定等第二代抗组胺药联合，有助于降低复发率 。对于儿童轻度持续性和中重度间歇性过敏性鼻炎，在常规治疗的基础上，可考虑联合应用通窍鼻炎颗粒，有助于改善鼻部过敏症状，降低复发率，对于儿童中重度持续性过敏性鼻炎，在常规治疗的基础上，可考虑联合应用通窍鼻炎颗粒，有助于改善鼻部过敏症状，用药前必须要经中医辨证。
通窍鼻炎颗粒在临床应用中无严重不良反应的文献报道，个别患者出现轻微瘙痒、皮疹、 恶心、头痛、头晕、疲倦、失眠、嗜睡等不良反应，但尚不能明确是否与通窍鼻炎颗粒存在因果关系，但其组方中的苍耳子具有一定毒性，长期使用可能会影响肝肾功能，因此，通窍鼻炎颗粒不推荐长期使用，间歇性过敏性鼻炎推荐使用2周，持续性过敏性鼻炎推荐使用4周。
